作为一种虫媒病毒，寨卡病毒最先在美洲被发现。自2014年起，共计30多个国家和地区出现该病毒。2016年2月1日，世界卫生组织召开紧急会议，宣布将寨卡病毒可能引发的小头症和其他神经疾患确定为“国际关注的突发公共卫生事件”。这是世卫组织依据《国际卫生条例》，对某一流行病严重程度发出的高级别警告。
巴西是寨卡疫情的重灾区，截至2016年1月30日，巴西大约感染150万人，已成为疫情最为严重的国家。而巴西里约奥运会是南美洲举办的首届奥运会，人们自然会担心，寨卡病毒会不会影响了里约奥运会的举办。
当时，里约奥组委新闻发言人菲利普·威尔金森表示，寨卡疫情不会对计划前往里约观看奥运会的游客造成太大影响。在奥运会和残奥会场馆中，每天都会根据当地卫生部门的指导来清除蚊子滋生的温床。此外，对于位于南半球的里约，奥运会开幕的8月正值冬季，气候相对凉爽，也不利于蚊虫滋生。
然而，许多专家并不认同这一说法。在里约奥运会开始前，曾有150名来自哈佛耶鲁牛津等顶尖研究机构的科学家们联名上书世界卫生组织，要求推迟或者干脆停办里约的奥运会。他们担心当地愈演愈烈的寨卡病毒会随着蜂拥而至的游客和运动员四处流窜，最终传遍全球。世卫组织拒绝了这个要求，说一切没他们想象的那么糟，但很快世卫就被指责和奥委会有勾结，看问题不公正。
里约奥运会期间，各国参赛选手纷纷来到巴西重灾区。各国选手为了积极筹备里约奥运会，参赛期间，不顾及蚊虫的叮咬，刻苦训练。世界卫生组织总干事陈冯富珍表示，应对寨卡虽然困难，但只要国家团结，没有什么不可能。她同时表示，巴西有足够经验承办大型赛事，寨卡不会对奥运会造成影响。陪同出席的巴西卫生部长马塞洛·卡斯特罗也表示，巴西正在积极寻找研发对抗埃及伊蚊的新技术，并且正积极与国际社会合作进行寨卡疫苗研发等工作。
如今，里约奥运会早已闭幕，从中并未看到寨卡病毒因奥运会而传播更甚的迹象。在11月，世卫组织解除了为期9个月的紧急状态，并在声明中表示，与寨卡病毒感染有关的小头症和其他神经疾患不再构成《国际卫生条例》所定义的“国际关注的突发公共卫生事件”。世卫组织在声明中也同时强调，寨卡病毒及其引发的病症仍然是一个重大的、持续的公共卫生挑战，需要采取强有力的行动。
